نمایندگان مجلس شورای اسلامی با اصرار بر تصمیم قبلی خود لایحه اصلاح قانون ارتقای سلامت نظام اداری و مبارزه با فساد اعاده شده از شورای نگهبان را به مجمع تشخیص مصلحت نظام ارجاع دادند.این لایحه برای بار دوم از سوی شورای نگهبان به مجلس اعاده شده بود و پس از لایحه پیوستن به کنوانسیون مبارزه با تامین مالی تروریسم(سی اف تی) که به مجمع تشخیص مصلحت نظام ارجاع شده بود، این لایحه نیز به مجمع تشخیص ارجاع شد. شورای نگهبان در این زمینه تاکید کرده است که اطلاق حکم ماده ۲۸ این لایحه نسبت به دستگاه هایی که در قانون اساسی دارای وظایف خاص هستند، با اصول ۵۷، ۶۰، ۱۵۶، ۱۷۰، ۱۷۳ قانون اساسی مغایرت دارد؛ در تبصره این ماده، تصویب آیین نامه توسط سران سه قوه مغایر اصول ۱۳۸ و ۱۵۸ قانون اساسی است.